Od dawna wiadomo, że szczepy probiotyków różnią się między sobą skutecznością w profilaktyce i leczeniu wielu chorób. Dowodem na tę tezę są wyniki badań opublikowanych w British Medical Journal. W opisywanym badaniu leczono dzieci w wieku 3-36 miesięcy chorujących na ostrą biegunkę. Dzieci losowo otrzymywały jeden z pięciu różnych zestawów probiotyków: Lactobacillus rhamnosus GG (LGG); Saccharomyces boulardii; Bacillus clausii; mieszankę szczepów L. delbrueckii var bulgaricus, Streptococcus thermophilus, L acidophilus i Bifidobacterium bifidum; oraz Enterococcus faecium SF68. Wykazano, że znamienne statystycznie skrócenie czasu trwania biegunki i zmniejszenie liczby oddawanych stolców uzyskano tylko po 2 preparatach: Lactobacillus GG i po mieszance 4 szczepów. Autorzy podkreślają, że spośród probiotyków należy wybierać preparaty o udokumentowanej naukowo skuteczności, ponieważ wiele komercyjnie dostępnych zestawów probiotyków nie wykazuje odpowiedniego działania.