Gospodarka wapniowo-fosforanowa podlega bardzo złożonym i wielopiętrowym regulacjom. Z tego powodu istnieje wiele potencjalnych przyczyn hipokalcemii.

Należy tu wymienić:

1. Niedobór witaminy D,

2. Niedobór parathormonu,

3. Choroby nerek,

4. Niedobór magnezu,

5. Niedotlenienie u noworodka,

6. Uszkodzenie śluzówki jelita cienkiego (celiakia, choroba Crohna),

7. Nadmiar fosforanów w diecie (np. przy żywieniu niemodyfikowanym mlekiem krowim) i wiele innych.

Niedobór wapnia jest potencjalnie stanem zagrażającym zdrowiu i życiu, ponieważ może prowadzić do zaburzeń rytmu serca, a także powodować drżenia i drgawki (tężyczka).