Niedobór fluoru jest stosunkowo częsty w naszym środowisku, zwłaszcza wśród małych dzieci, które nie używają jeszcze fluorowanych past do zębów. Głównym źródłem fluoru dla małych dzieci jest woda pitna, która aby zaspokoić w pełni zapotrzebowanie dziecka na fluor, powinna zawierać co najmniej 0,7 mg F na litr wody. W niektórych rejonach naszego kraju związki fluoru występują także w powietrzu, będąc zanieczyszczeniem pochodzącym z zakładów przemysłowych. Niedobór fluoru powoduje skłonność do odwapnienia i próchnicy zębów. Nadmierne spożycie fluoru jest dużo rzadsze od jego niedoboru. Dotyczy to endemicznych regionów, gdzie woda pitna zawiera powyżej 2 mg F na litr wody, lub gdzie występuje znaczne zanieczyszczenie powietrza wyziewami zawierającymi fluorki. Nadmiar fluoru może powodować osteoporozę oraz zaburzenia czynności tarczycy i nerek.